[生体分子][思い出][イラスト]分子・生体分子の系譜(番外)／「分子の牧場」の繋がり [こども省 から]
一昨日の画像のヌクレオソームの別角度のアニメが，以下のページに出ていることを偶然知る。 iroiroな研究と論文の紹介　タンパク質やDNAに関して（化学の学生さん） このページは以前， 分子・生体分子の系譜(4)／「分子の牧場」のこと で取り上げたイラストの作者によるも  続きを読む
Date: 2006-09-17 16:57　ID: 3606380

[生体分子][安全]気の早いクリスマスリース [こども省 から]
本日更新の「今週の分子」は， ヌクレオソームコアの構造例（PDBデータ1EQZより）（要・Chimeインストール） と題名は難しいが，2005/08/20に取り上げた丸善「化学便覧 基礎編」CD-ROMに載っているPDBデータを見ている中で，標題のようにクリスマスリースに見えるものがあっ  続きを読む
Date: 2006-09-17 16:57　ID: 3606378

[生体分子][生と死][書籍]DNAの四重らせん構造と「テロメアの帽子」 [こども省 から]
昨日で職場の夏休みも終わって今日からまた賑やかになる。それと同時に，分子表示ツールChimeを使った連載「今週の分子」も再開。本日の再開第1弾は2005/08/27に取り上げたDNAの二重らせんならぬ四重らせん構造の話題。 DNAのG-四重らせん構造の例（PDBデータ2A5Rより） ＝  続きを読む
Date: 2006-09-17 16:56　ID: 3606376

[生体分子]DNAの変幻自在 [こども省 から]
元素の種類が100あまり，タンパク質の構成アミノ酸の種類が20種類（構成元素はC，H，N，O，S），DNAの塩基が4種（ATGC；構成元素はC，H，N，O，P），というのが地球型生命体の基本レシピの材料。そのために同じものを違う場所では別な用途に使うなどいろいろ使い回しをした  続きを読む
Date: 2006-09-17 16:56　ID: 3606373

[プログラミング][生体分子]秀丸マクロでタンパク質中のBCAAの多寡を見る [こども省 から]
今朝ふと思いついて，2005/02/10に書いた秀丸マクロの新作にチャレンジ。その翌日に最近よく耳にするBCAA（Branched Chain Amino Acids，分岐鎖アミノ酸）およびタンパク質の立体構造保持などにしばしば重要な役目を果たすCys（システイン）の含量をわかるようにしようとい  続きを読む
Date: 2006-09-17 16:55　ID: 3606370

[書籍][生体分子]生体分子本三昧 [こども省 から]
今日bk1から届いた発注本。コンテンツ作成などでしばらく楽しめそう。書名のリンクはbk1へ。 分子科学研究所 編，「分子科学者がいどむ12の謎」，化学同人(2005) 4章『生物が重金属の毒性を避けるしくみをさぐる』に，昨日取り上げたばかりの，ファイトレメディエーションや  続きを読む
Date: 2006-09-17 16:54　ID: 3606365

[環境][生体分子]バイオレメディエーションとファイトレメディエーション [こども省 から]
毎年，米の収穫時期に問題になるのがカドミウム汚染米。鉱山から流れ出るなどして水田の土壌に含まれたカドミウム（Cd）が米に吸収されるもの。 食品に含まれるカドミウムについて（厚生労働省） 主にこのカドミウムや鉛などの重金属を吸収しやすい植物を使って土壌から除去  続きを読む
Date: 2006-09-17 16:54　ID: 3606362

[ナノ][生体分子][STS]ナノ学会第3回大会の参加報告 [こども省 から]
2005/04/24や2005/05/09に書いたように，2005/05/08-10に仙台で開催されたナノ学会第3回大会に参加。自分のポスター発表の要旨を転載し，年会の様子を紹介するページも作成した。なお，私の発表は一般には認知度が低いと思われる広範なナノテクノロジーの最新成果を，科学コ  続きを読む
Date: 2006-09-17 16:53　ID: 3606353

[環境][合成化合物][食物連鎖][有機塩素化合物][大人との違い][人間との違い]野生生物やこども達にはリスクだけが [こども省 から]
昨日環境ホルモンのことを書いたが，今朝になって以下のニュース。 シャチ集団死：死体から異常に高いPCBを検出　北海道（毎日，2005/03/06） 便利な化学物質を使うときに“リスクとベネフィット”ということ考え方を使う場合がある。例えば薬には薬効と副作用があり，食べ  続きを読む
Date: 2006-09-17 16:52　ID: 3606347

[生体分子][分子の面白さ][視覚]モノはなぜ見える [こども省 から]
人間にとって大事な視覚情報の受容器もタンパク質。アニメーションがその例のロドプシンで（PDBデータ1F88のChain A），αらせん型の部分が細胞膜を貫通しているタイプのタンパク質で，嗅覚・味覚も似たような仕組みになっている。タンパク質の中央にある折れ曲がった灰色の  続きを読む
Date: 2006-09-17 16:51　ID: 3606345

[生活のリズム][睡眠][書籍][番組][生体分子][生命時計]子ども達の睡眠不足・睡眠の乱れと生命時計 [こども省 から]
2005/02/23の日記に朝食のことで書いたこども達の生活のリズムに関連して睡眠の方では， メールやコンビニが悪影響　深刻な高校生の睡眠不足（河北新報，2005/02/26） というニュース。人類がプロメーテウスから火をもらい，エジソンの電球の発明などを経て，暗くなったら寝  続きを読む
Date: 2006-09-17 16:50　ID: 3606341

[番外][分子の面白さ][生体分子][アニメgif]ネットのパラパラ漫画 [こども省 から]
初めてアニメgifを見たのは，昔のある公的機関のサイトで，データはgifなのにどうして動いているのかと驚いたのを憶えている。カラー画像が魅力の一つのWebページに，動きが加わればさらに表現力は高まる。 あれこれ調べて作成に必要なツールも集めて時々思い出したようにア  続きを読む
Date: 2006-09-17 16:50　ID: 3606333

[プログラミング][生体分子][書籍]秀丸マクロをライブラリに登録 [こども省 から]
2005/02/10の日記に書いた， １文字アミノ酸配列から各種HTMLデータを作成する秀丸マクロ 作例：βバレル型膜貫通タンパク質の疎水性インデックス値（冒頭の画像は同ページ掲載のもの） を秀丸エディタのマクロライブラリに登録。ダウンロードランキングでは今のところ18件  続きを読む
Date: 2006-09-17 16:49　ID: 3606326

[生体分子][DNA][分子の美しさ][ミーム]分子・生体分子の系譜(1)／日本初のDNA分子模型 [こども省 から]
昨日書いたように，吉田弘先生からは日本の化学研究の歴史に関する話もいろいろメールで教えていただき，遡って寺田寅彦の名前まで登場したことなど度々少なからぬ興奮を覚えた。 その中で，吉田先生が学位をとられたのが田隅三生先生のところで，田隅先生は私がいつもお世  続きを読む
Date: 2006-09-17 16:48　ID: 3606324

[生体分子][分子の美しさ]“生体分子は休むことなく働いている” [こども省 から]
一昨日の日記で取り上げた記事『アートとしての科学』で紹介されていた作品の中には，Emad TajkhorshidとKlaus Schultenによるアクアポリンの画像もあって，そちらの方は， Structure, Dynamics, and Function of Aquaporins でアニメーションも参照できる。 こういう作品を  続きを読む
Date: 2006-09-17 16:47　ID: 3606322

[生体分子][番組][出会い]シトクロムP450タンパク質のCG [こども省 から]
10/04の日記に書いた先日の東京の学会で，発表したのが標題のタンパク質のデータ集を公開した話。 P450データ集メニュー P450部分データ集（3D分子参照にはChimeのインストールが必要） 体内で解毒などの大事な働きをしている一群で，“おにぎり型”や“プリズム型”とよば  続きを読む
Date: 2006-09-17 16:47　ID: 3606320